優點：
(1)分離效率高。幾十種甚至上百種性質類似的化合物可在同一根色譜柱上得到分離，能解決許多其他分析方法無能為力的復雜樣品分析。
(2)分析速度快。一般而言，色譜法可在幾分鐘至幾十分鐘的時間內完成一個復雜樣品的分析。
(3)檢測靈敏度高。隨著信號處理和檢測器制作技術的進步，不經過預濃縮可以直接檢測10叫g級的微量物質。如采用預濃縮技術，檢測下限可以達到10-12g數量級。
(4)樣品用量少。一次分析通常只需數納升至數微升的溶液樣品。
(5)選擇性好。通過選擇合適的分離模式和檢測方法，可以只分離或檢測感興趣的部分物質。
(6)多組分同時分析。在很短的時間內(20min左右)，可以實現幾十種成分的同時分離與定量。
(7)易于自動化。現在的色譜儀器已經可以實現從進樣到數據處理的全自動化操作。
缺點：
定性能力較差。為克服這一缺點，已經發展起來了色譜法與其他多種具有定性能力的分析技術的聯用。