對克拉霉素或其他大環內酯類藥過敏者禁用。
長期及大劑量服用可引起膽汁淤積和肝酶升高，尤其是酯化紅霉素較易引起。
還可致耳鳴、聽覺減退，注射給藥較易引起。
其他常見消化道反應，藥物熱、皮疹、蕁麻疹等過敏反應。
心血管系統可見室性心律失常、室速、Q-T間期延長等。
克拉霉素為抑菌性藥物，給藥應按一定時間間隔進行，以保持體內藥物濃度，利于作用發揮。
克拉霉素片應整片吞服，若服用藥粉，則受胃酸破壞而發生降效。幼兒可服用對酸穩定的酯化紅霉素。
靜脈滴注易引起靜脈炎，滴速宜緩慢。
克拉霉素在酸性輸液中破壞降效，一般不應與低pH的葡萄糖輸液配伍。在5%～10%葡萄糖輸液500ml中，添加維生素C注射液（抗壞血酸鈉1g）或5%碳酸氫鈉注射液0.5ml使pH升高到5以上，再加克拉霉素乳糖酸鹽，則有助穩定。
妊娠期婦女、哺乳期婦女、慢性肝病及肝功能損害者慎用。