來自巴斯德研究所(Institut Pasteur)、法國國家科學研究中心和悉尼大學的科學家們,通過對在幾內亞流行的埃博拉病毒株進行基因組測序,追蹤了病毒的傳播,并監測了這一國家的病毒進化情況。
研究揭示出有三種不同的病毒變種在幾內亞,尤其是首都的城市區域和附近的市鎮同時傳播,研究人員在發表于6月24日《自然》(Nature)雜志上的一篇文章中描述了這三種病毒變種的突變。鑒別出埃博拉病毒遺傳變異的特征,對于確保診斷工具持續發揮效力,及開發出有效的治療和疫苗具有至關重要的意義。
埃博拉疫情在西非已持續了一年多,已報道27,341例病例,其中11,184人死亡。這場疫情已被查明起源于幾內亞東南部的一片森林地區,從那它快速傳播到了首都、科納里克(Conakry)及周邊國家。2014年3月,巴斯德研究所在達喀爾醫院建立了一個移動實驗室,為整個幾內亞提供診斷服務。
監測埃博拉病毒基因組的進展是開發出更好的治療策略,設計有效的疫苗以及確保診斷工具持續地發揮效力的關鍵。為此目的,巴斯德研究所、法國國家科學研究中心和悉尼大學的科學家們鑒別了在2014年7月-11月間在幾內亞流行的埃博拉病毒株的特征,為國際社會抗擊這一疾病付諸的努力做出了貢獻。
通過對只包含少量生物物質的稀少樣本進行病毒測序,分析這些序列揭示出了有三種不同的病毒變種在幾內亞同時流行,顯示出與塞拉利昂和利比里亞觀察到的非常不同的動態。
第一種病毒變體GUI-1與2014年3月疫情開始爆發時采集的病毒關系密切。這一變體只存在于幾內亞的城市和森林地區。
第二種病毒變體GUI-2與在塞拉利昂流行的病毒有關聯,有可能對應了在幾內亞的平行進化。這些序列揭示出了在2014年10月和11月導致埃博拉病毒兩次獨立地輸入馬里共和國的一個缺失的環節。
第三個病毒變種被確定存在于科納克里和周邊城鎮。這一病毒變體與在塞拉利昂發現的病毒顯著相似,結合流行病學資料,表明來自塞拉利昂的埃博拉病毒多次重復輸入到了科納克里的周邊地區。
每種變體均是通過突變組合來進行定義,這些突變組合影響了不同病毒蛋白,特別是VP35蛋白(有可能是一種毒力因子),病毒包膜糖蛋白(有可能改變了免疫系統感知病毒),或通常更為保守的病毒區域聚合酶。
盡管這項研究突顯出了在疫情傳播期間在幾內亞流行的病毒的遺傳多樣性,它也表明了突變率在從前描述的這類病毒的突變率范圍內。監測病毒變異有力補充了回顧傳播鏈的流行病學研究,將促成在面對潛在的新疫情時制定出更具針對性的應對策略。最后,有關埃博拉病毒遺傳變異的研究還將幫助優化開發中的療法和疫苗。
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