培養基按其特殊用途可分為加富培養基、選擇性培養基和鑒別培養基。
(1)加富培養基。是在培養基中加入血、血清、動植物組織提取液，用以培養要求比較苛刻的某些微生物。
(2)選擇性培養基。是根據某一種或某一類微生物的特殊營養要求或對一些物理、化學抗性而設計的培養基。利用這種培養基可以將所需要的微生物從混雜的微生物中分離出來。
(3)鑒別培養基。是在培養基中加入某種試劑或化學藥品，使培養后會發生某種變化，從而區別不同類型的微生物。
