①豌豆的紅花與白花基因，除控制豌豆花色遺傳以外，紅花基因還能使葉腋有紫斑，種皮為褐色；白花基因則不能。水稻的矮生基因除能控制水稻植株長矮之外，還能促使分蘗力強，葉色深綠。
②翻毛雞的翻毛基因，不僅影響雞羽的反卷，而且還影響其體溫下降，心跳增快，心、脾擴大，生育力降低等，這說明基因通過生理生化過程而影響一系列性狀的表現。 [2]
③又如苯丙酮尿癥，經典型PKU原發缺陷為遺傳性缺乏苯丙氨酸羥化酶，患者血、尿中苯丙氨酸和苯丙酮酸水平升高。其繼發癥狀為：嚴重智力發育障礙；苯丙氨酸不能轉變為酪氨酸，黑色素相應減少，發色變淺；激動行為，多動；反射功能亢進，肌肉緊張過度；患者有霉臭或鼠臭。
④再如鐮狀細胞貧血，其原發效應是由于血紅蛋白β鏈第6位谷氨酸被纈氨酸取代，形成變異型血紅蛋白HbS，純合子患者血紅蛋白溶解度下降，紅細胞鐮變。其繼發癥狀為：貧血可導致脾腫大、虛弱、倦怠；紅細胞黏滯度增高可導致血栓形成和梗死。根據血栓形成部位的不同出現各種不同的癥狀，如心力衰竭、血尿、腎衰竭、腦血管意外、四肢疼痛及腿部潰瘍、腹部疼痛、脾梗死等。這是基因多效性的一個非常典型的例子。