狹義上僅指基因工程。
是指將一種生物體（供體）的基因與載體在體外進行拼接重組，然后轉入另一種生物體（受體）內，使之按照人們的意愿穩定遺傳，表達出新產物或新性狀。
重組DNA分子需在受體細胞中復制擴增，故還可將基因工程表征為分子克隆（Molecular Cloning）或基因克隆（Gene Cloning）。
廣義上包括傳統遺傳操作中的雜交技術、現代遺傳操作中的基因工程和細胞工程。
是指DNA重組技術的產業化設計與應用，包括上游技術和下游技術兩大組成部分。
上游技術：基因重組、克隆和表達的設計與構建（即DNA重組技術）；
下游技術：基因工程菌（細胞）的大規模培養、外源基因表達產物的分離純化過程。
廣義的基因工程概念更傾向于工程學的范疇。
廣義的基因工程是一個高度的統一體：
上游重組DNA的設計必須以簡化下游操作工藝和裝備為指導思想；
下游過程則是上游重組藍圖的體現與保證。---基因工程產業化的基本原則。
基因工程是指重組DNA技術的產業化設計與應用，包括上游技術和下游技術兩大組成部分。上游技術指的是基因重組、克隆和表達的設計與構建（即重組DNA技術）；而下游技術則涉及到基因工程菌或細胞或基因工程生物體的大規模培養以及基因產物的分離純化過程。