（1）轉化：是受體菌直接攝取供體菌提供的游離DNA片段整合重組，使受體菌的性狀發生變異的過程。
（2）轉導：是以溫和噬菌體為媒介，將供體菌的基因轉移到受體菌內，導致受體菌基因改變的過程。
（3）接合：是受體菌和供體菌直接接觸，供體菌通過性菌毛將所帶有的F質粒或類似遺傳物質轉移至受體菌的過程。
（4）溶原性轉換：是噬菌體的DNA與細菌染色體重組，使宿主菌遺傳結構發生改變而引起的遺傳型變異。
（5）原生質體融合：兩種經過處理失去細胞壁的原生質體混合可發生融合，融合后的雙倍體細胞可發生細菌染色體間的重組。