基質輔助激光電離質譜儀的特點：
質譜系統具有功能多樣及高通量的特點，可實現蛋白質及多肽檢測、核酸檢測、微生物檢測多種功能，且具有快速檢測大樣本量標本的特點，該系統適合應用于臨床檢驗項目。不同分析目標要求不同的樣品處理及研究方法。
1.疾病蛋白質組研究：樣品（體液/組織/細胞）中的蛋白、多肽提取（液相色譜/固相芯片/液相芯片）→質譜檢測→軟件分析圖譜→多肽鑒定→臨床模型建立。
2.基因組學研究：樣品中的DNA提取→PCR擴增→SAP消化→單堿基延伸→樹脂純化、上樣→質譜檢測→核酸分型。
3.微生物組學研究：菌種分離→菌種培養→樣本提取、上樣→質譜檢測→微生物譜庫檢索、鑒定。