Ⅳ型膠原酶為其中重要的一類，它主要有兩種形式，一種被糖化，分子量為92kD，命名為MMP-9;另一種非糖化，分子量為72kD，被稱為MMP-2。當前對MMP-2，MMP-9的研究較深入。
MMP-2基因位于人類染色體16q21，由13個外顯子和12個內含子所組成，結構基因總長度為27kb，與其他金屬蛋白酶不同，MMP-2基因5’旁側序列促進子區域含有2個GC盒而不是TATA盒。活化的MMP-2定位于細胞穿透基質的突出部位，估計其在酶解細胞間基質成分及基底膜的主要成分Ⅳ型膠原中有“鉆頭”的作用。
此外，已證實MMP-3 和MMP-10能作用于PG、LN、FN、Ⅲ型和Ⅳ型膠原及明膠。且MMP-3能夠激活MMP-1和其他家族成員。MMP-7能作用于明膠和FN。MMP-1的產生范圍較廣，可由基質纖維母細胞、巨噬細胞、內皮細胞、上皮細胞產生。正常情況下MMP-1陽性率很低，但在各種刺激下可高表達。有研究顯示惡性腫瘤中MMP-1高表達與預后相關。
MMPs的活性受到三個水平的調節，即基因轉錄水平，無活性酶前體經蛋白水解作用而激活以及特異性抑制因子（TIMP）的作用。