三、認證>參數
在保證檢測可靠的基礎上，不同儀器的下一個差異就體現在檢測的靈敏度上面，這時人們關心的就是儀器能夠檢測到多弱的信號。
靈敏度涉及了整個光路系統的設計和選料，很難說某一個部件會起決定性作用。但是有一點，在各種單功能檢測項目中，光吸收檢測用非放大型的光電二極管、熒光檢測用光電倍增管、發光檢測用專門設計的單光子計數光電倍增管，這三種不同的檢測器是各自檢測領域的優先選擇。
各單項檢測的最優結果都是用相應檢測器完成的。當然也有的儀器出于成本等考慮，用一個檢測器兼容多種檢測模式，這在一定程度上也能完成實驗需求，但是在性能上也會有所犧牲折中，無法實現各項檢測都達到最優化。
關于靈敏度的定義和檢測標準，每個廠家都有各自的描述，都會說自己是怎樣怎樣好，很難有一個直觀的客觀比較。因此，某些試劑廠家就站了出來，對某些儀器的檢測性能提供一個第三方的認證。
比較常見的是發光檢測領域里面的Promega公司DLReady認證，熒光檢測領域的Invitrogen公司的LanthaScreen系列認證、Cisbio公司的HTRF認證、BellBrook實驗室的Transcreener認證等等。這些認證主要是針對公司提供的某一類型的要求較高的試劑盒，涵蓋了對檢測儀器的各種性能要求，包括：檢測方法是否能用，靈敏度、線性范圍、孔間干擾等是否滿足要求等等。
如果需要做相關的實驗，例如做Luciferase發光檢測的就看看儀器是否有DLReady認證、做TR-FRET的就看看HTRF認證、做FP就看看Transcreener認證，如果機器擁有相關的認證，就可以說明該機器在一定程度上能夠較好地滿足類似檢測的各種需求，遠比單單比較一個靈敏度參數更能說明問題。因為一個實驗能否做好并不是單單一個靈敏度就能表征的。
需要特別注意的是，LanthaScreen是一個系列的認證，涵蓋了FI、FRET、TRF、FP等多個子項目，不同儀器所通過的子項目是不一樣的，需要上Invitrogen網站仔細查詢核對。
光柵型的儀器由于新技術近幾年才逐漸興起，受限于技術研發和儀器成本，同一個價格范圍內的靈敏度等指標會略差于發展成熟的濾光片機器。所以，在中檔多功能酶標儀領域，拿到了各種認證的光柵型儀器并不多見。
而作為新一代光柵型酶標儀的代表作，TECAN M1000已經拿到了全部上述四種認證，而且在靈敏度等單項性能上也已經超越了不少的中高端濾片型酶標儀。
這說明了光柵型酶標儀的研發又進入了一個新的高度，除了在靈活性上取得了無可替代的作用外，還在檢測靈敏度等方面也逐漸替代傳統的濾光片型酶標儀。光柵型是科研領域多功能酶標儀的未來主要發展趨勢;而濾光片型儀器也正在往單項性能更優的方面改進。
四、比色杯+微量檢測
除了常規的6～384/1536孔酶標板檢測之外，有些儀器還附帶了比色杯、微量檢測板等的兼容功能。無論是使用立式比色杯、臥式比色杯還是各種微量檢測板，其目的都是給光程不固定的酶標板檢測引入一個標準光程的概念。雖然酶標板檢測也能通過光程校正等方式實現10mm光程OD值的換算，但這只是一個數學轉換過程，檢測誤差累積較多，實際使用效果不佳。引入比色杯和微量檢測板后，光吸收的檢測光程就被固定在10mm或者0.5mm等的標準長度，OD值換算更加簡單和準確。附帶了此類檢測功能的酶標儀，相當于除了本身的多功能酶標檢測之外，還能替代部分分光光度計的功能，使其功能更加全面，儀器的性價比更高。
五、品牌與售后
不同品牌的儀器往往性能側重點有所不用。例如，PE公司由于在試劑領域有較深底蘊，他們的酶標儀在配合使用他們的TRF系列檢測試劑盒上作了多項優化，因此PE的酶標儀普遍來說在TRF領域會有較多的特色功能和相對較高的性能指標。而像TECAN，就把研發的重點放在了四光柵的研究方面，近年來相繼推出了第二和第三代光柵型多功能酶標儀(M200、M1000)，成為四光柵酶標儀領域的領頭羊。而像多功能酶標儀上加入比色杯、微量檢測板等功能也是TECAN從用戶角度考慮作出的技術創新，后來此類技術都成為了Thermo、BioTek等品牌紛紛仿效的對象。
最后，無論是一臺多好的酶標儀，脫離了良好的售后服務體系也是難以正常運作的。今年，各家廠商都在中國國內設立了辦事處甚至亞太區總部，有些產品還專門研發了中文版的軟件和說明書。這都說明了廠家對中國市場的重視。而正因為這種重視，無論是廠家直銷還是選擇代理分銷，都會對國內的售后服務提出各自的要求和期望，最基本的就是普及儀器的應用工程師和維修工程師網絡體系。
可以說，國內的各大城市里面，基本已經做到了部分品牌總有一個工程師在你身邊。選購之前多與工程師交流，充分了解各家的性能特長和售后情況，反復對比，總能找到最適合自己需要的一款多功能酶標儀。