臨床醫生通常以大便常規檢查結果了解病人胃腸道疾病。排泄物也能體現身體狀況，似乎有些神奇。當了解這些檢驗指標及臨床診斷指導意義后，會讓你真正知道小事情有大學問：正常大便的組成主要為食物的殘渣、水分及腸道的大量細菌，并伴有胃、肝、胰、腸的分泌物及腸內的分解產物。因此大便檢查對了解胃腸、肝臟、胰腺疾病及其功能狀態有很大幫助。尤其是嬰幼兒的大便檢查，對診斷疾病很有參考價值。
大便標本取樣
標本的留取要新鮮，盛裝容器選用一次性塑料杯（很多醫院直接使用尿杯也行）或干潔的玻璃瓶內（容器應是干凈不吸水材質），標本內不能混入小便或白帶，留取標本后應及時送檢。檢查時，便內混有膿、血、粘液，應采集膿血粘液部分。
大便常規檢查包括外觀檢查，化學檢查，顯微鏡檢查，輪狀病毒檢查。
大便外觀檢查
顏色改變：飲食、藥物或在病理情況下均可使大便顏色改變。正常大便顏色為棕色。黃色多為小兒正常顏色或服用大黃等藥，病理情況下有未經改變的膽紅素。食用大量含葉綠素的蔬菜后呈綠色。灰白色在鋇餐后及服矽酸鋁后出現，病理情況為膽道梗阻、阻塞性黃疸等。黑色或柏油狀見于各種原因引起的上消化道出血，服鐵劑、鉍劑或進食動物血、肝臟亦可呈黑色。果醬色多為阿米巴痢疾或腸套疊，食用大量咖啡巧克力后亦可出現醬色。紅色見于下消化道出血如痔瘡、肛裂、腸息肉、結腸癌、痢疾等，或食用西紅柿、西瓜后。
性狀改變：稀粘便多是服用緩瀉劑后。水樣便為急性腸炎、食物中毒等。嬰幼兒腹瀉常見蛋花湯樣便；霍亂或付霍亂可見米泔水樣便；嗜鹽菌食物中毒可見洗肉水樣便；赤豆湯樣便要考慮出血性小腸炎。粘液膿血便見于急、慢性痢疾。凝乳塊多為嬰幼兒脂肪或酪蛋白消化不良、飲食過多所致。含不消化食物多為腸功能不佳。
化學檢查
糞膽素：正常人大便中均有糞膽素，使大便呈棕黃色。如膽汁制造及分泌增多時，糞膽素含量增高，見于溶血性貧血。如膽總管因結石或腫瘤堵塞，糞膽素可減少或全無，此時大便呈灰白色或白陶土色。
隱(潛)血試驗：消化道出血量少于100毫升則肉眼及鏡檢不能發現大便內的血液，隱血試驗可幫助臨床診斷。正常人在忌食動物血和含葉綠素食物時，隱血試驗呈陰性。多次、持續性隱血試驗陽性，提示消化道慢性出血，應進一步檢查警惕胃腸道腫瘤的存在。近些年由于環境、蔬菜、飲用水污染加重，消化道腫瘤的發病率也在升高。因此人們在常規查體時不可忽略無創傷、無痛苦的大便隱血試驗，以便早期發現消化道腫瘤并使患者得到及時治療。為了避免出現假陽性，在取標本做隱血試驗前三天，必須禁食動物血、肉類、青菜以及含鐵藥物。
顯微鏡檢查
大便涂片鏡檢：除可發現寄生蟲卵、原蟲外，尚可觀察不同結構的消化產物。
紅細胞：見于下消化道出血、腸道炎癥、腸結核、結腸腫瘤等。
白細胞：腸道有炎癥時，鏡檢可見白細胞，量的多少與炎癥輕重有關。常見急性胃腸炎、痢疾。
巨噬細胞：急性細菌性痢疾可見到。
上皮細胞：由腸道黏膜脫落而來，在潰瘍性結腸炎時多見。
人體酵母菌：腹瀉病人常見。嬰幼兒鏡檢如酵母菌較多，特別是出現致病性霉菌，應警惕因抗生素應用過多，導致機體的菌群失調。
寄生及蟲卵：常見有蛔蟲、蟯蟲、鉤蟲及鞭蟲。
原蟲類：如阿米巴、滴蟲及梨形鞭毛蟲等。
食物殘渣：如大量脂肪球、肌肉纖維、淀粉顆粒和植物細胞，見于胃腸消化不良、胰腺疾患、服用中草藥等。
結晶：在阿米巴痢疾或其他過敏性疾病可找到尖棱形結晶。
嬰幼兒高熱、腹痛，并伴有早期中毒性休克癥狀，但未見排便，在高度懷疑中毒性菌痢的情況下，做一個肛拭子涂片，顯微鏡檢查便可確定診斷。
輪狀病毒檢查
輪狀病毒檢查對季節性小兒腹瀉有很大指導意義。