頭孢尼西鈉具有廣泛的抗菌作用，主要針對以下敏感菌引起的感染：
下呼吸道感染；
尿路感染；
敗血癥；
皮膚和軟組織感染；
骨和關節感染；
也可用于手術預防感染。
例如，在外科手術前單劑量注射1g頭孢尼西可以減少由于手術過程中污染或潛在的污染而導致的術后感染發生率。在剖腹產手術中使用頭孢尼西（剪斷臍帶后）還可以減少某些術后感染發生率。
