女性泌尿生殖系統結構的特殊性，女性的尿道較男性短且寬弛，細菌易于進入。尿道炎的危害可以影響身體和日常生活。
1、引起各種不適癥狀：病菌在感染尿道后，會在尿道上造成膿瘍，日后結疤的結果會使尿道狹窄，病患會感到小便困難及尿流細小。另外，分泌物增多，外陰瘙癢等癥狀，讓不少女性尷尬不已。
2、引發不孕癥：攝護腺可能受到侵襲產生攝護腺炎，病患會有會陰部疼痛及下背部疼痛的癥狀，嚴重時會導致不孕。
3、尿道炎的危害有造成關節炎：感染嚴重時，細菌侵犯到膝關節內會造成關節炎。
4、影響后代：受感染的婦女生出來的孩子可能會患上結膜炎。