好氧生物法處理溶解的、膠體的、固體的有機物。厭氧生物法處理有機污泥和高濃度的有機廢水。好氧生物法處理廢水時間短厭氧生物法處理廢水時間長。好氧生物法處理廢水需要供給氧氣。厭氧生物法處理廢水不需供給氧氣,同時還可產生甲烷。好氧生物法處理廢水有大量的污泥產生。厭氧生物法處理廢水污泥產量低。好氧生物法處理廢水無臭氣。厭氧生物法處理廢水有臭氣產生。