表一:波長組
| 指定 | 激發 | 發射 | 適用于 |
| UV - 紫外線 | 360 - 380nm | 415nm長波通 | Dapi |
| VI - 紫羅蘭 | 400 - 415nm | 450nm長波通 | 藍色熒光蛋白 青色熒光蛋白 |
| RB - 皇家藍 | 440-460nm | 500nm長波通 | 綠色熒光蛋白 |
| RB - 皇家藍 | 440-460nm | 500 - 560nm帶通 | 綠色熒光蛋白 |
| CY - 青色 | 490 - 515nm | 550nm長波通 | 黃色熒光蛋白 |
| GR - 綠色 | 510 - 540nm | 600nm長波通 | 紅色熒光蛋白 |
熒光物質的激發波長的選擇
| Fluorescent Protein/Dye | UV(紫外線) | VI (紫色) | RB(藍色) | CY(青色) | GR(綠色) |
| Alexa Fluor 488 | √ | ||||
| Alexa Fluor 555 | √ | ||||
| Alexa Fluor 568 | √ | ||||
| Alexa Fluor 594 | √ | ||||
| amCyan1 | √ | ||||
| Aquamarine | √ | ||||
| Calcein | √ | ||||
| Cerulean | √ | ||||
| CFP | √ | ||||
| Citrine | √ | ||||
| Clover | √ | ||||
| Cy3 | √ | ||||
| CyOFP1 | √ | ||||
| CyPet | √ | ||||
| DAPI | √ | ||||
| DASPEI | √ | ||||
| Dextran-FITC | √ | ||||
| Dextran-Texas Red | √ | ||||
| Dextran-TRITC | √ | ||||
| DiI | √ | ||||
| DsRed | 2 | 推薦 | |||
| DsRed Dimer2 | √ | ||||
| E2-Orange | √ | ||||
| EBFP | √ | ||||
| EBFP2 | √ | ||||
| ECFP | √ | ||||
| EGFP | √ | ||||
| eqFP670 | √ | ||||
| EYFP | √ | ||||
| FAM (fluorescein) | √ | ||||
| FITC | √ | ||||
| Fluorescein | √ | ||||
| FusionRed | X | ||||
| Fluorescent Protein/Dye | UV | VI | RB | CY | GR |
| GFP | √ | ||||
| Hoechst | √ | ||||
| iFP1.4 | 推薦 | 2 | |||
| KO1 | √ | ||||
| LSSmOrange | √ | ||||
| Lucifer Yellow | √ | ||||
| mAmetrine | √ | ||||
| mApple | √ | ||||
| mAzamiGreen | √ | ||||
| mBanana |
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