光合儀和熒光儀可以獨立存在,但是光反應和暗反應不會獨立運行。所以,兩者沒有絕對意義上的高下,因為光反應和暗反應同樣重要。如果想全面的分析光合作用,光合儀和熒光儀都需要用到,最佳的使用方案是聯用,同步測量氣體交換和葉綠素熒光。