1.非霍奇金淋巴瘤的發病機制 由于淋巴細胞的分化階段不同，因而在受侵的淋巴結或淋巴組織中可出現不同階段的瘤細胞。在同一病灶中可有低分化的瘤細胞，也可有分化較為成熟的細胞。隨著病變的進展惡性淋巴瘤的組織學類型可有轉變，如結節型可轉變為彌漫型。
增生的腫瘤組織可呈單一細胞成分，但由于原始多能干細胞可向不同的方向分化，有時細胞成分可是2種以上或多種多樣的。
近年來由于單克隆抗體和免疫組化的廣泛應用，已有可能辨別不同分化階段的T、B淋巴細胞。
發生于包膜下皮質胸腺細胞的腫瘤通常是T細胞急性淋巴細胞白血病和淋巴母細胞淋巴瘤。所有其他T細胞淋巴瘤都是來自比較成熟的T細胞，CD4陽性其中包括成人T細胞淋巴瘤(ATL)、蕈樣霉菌病Sezary綜合征多數所謂的周圍性T細胞淋巴瘤(國際工作分類中的彌漫大細胞免疫母細胞和混合性淋巴瘤)及半數以上的T細胞慢性淋巴細胞白血病有一些周圍T細胞淋巴瘤、近半數的T細胞慢性淋巴細胞白血病和一些Tγ淋巴增生性疾病CD8陽性。
B細胞淋巴瘤的特異性抗體較少，但有表面免疫球蛋白表達。最早期的B細胞表面有CD10、CD19的表達，細胞內有終端轉移酶并有重鍵基因的重組。以后細胞表達CD20細胞質內產生μ重鍵，κ輕鍵基因的重組、λ輕鍵基因的重組及終端轉移酶脫失這些代表發展中的前B細胞階段。細胞丟失CD10的表達以后即成為不成熟的B細胞，表面有IgM表達。以后細胞表面表達CD21受體(C3b)膜上產生IgD和IgM。所有B細胞的發展階段都是在抗原刺激下發生的，同時免疫球蛋白基因在接受抗原刺激后被啟動而分泌。此后，細胞丟失CD21、CD20和表面免疫球蛋白，獲得漿細胞的標記物PC-1和PC-2分泌免疫球蛋白。這是細胞濾泡中心B細胞的發展過程，發生惡性變后即成為淋巴細胞淋巴瘤。
濾泡中心B細胞的成熟和免疫球蛋白基因的啟動均受T輔助細胞調控，但也有一些不明的B淋巴細胞。套細胞區的B細胞似乎相對比較少受T細胞的影響，這些細胞CD5陽性，這是一全T細胞標記物，似乎也與免疫球蛋白無關。
多數急性淋巴細胞的白血病來源于前B細胞Burkitt淋巴瘤及白血病來源于表面IgM陽性的不成熟B細胞，多數濾泡性和彌漫性B細胞淋巴瘤來自成熟的或活化的B細胞。巨球蛋白血癥(Waldenstrom綜合征)和多發性骨髓瘤則來自分化的終末階段，慢性淋巴細胞白血病表達CD5，彌漫性中等分化淋巴瘤表達CD5及CD10，可能說明這些是來自套細胞區而不是濾泡中心的B細胞。
有些淋巴瘤的免疫分型及臨床表現還很混亂彌漫大細胞淋巴瘤可能最不均一可來自B細胞T細胞及組織細胞。所以，這些病人的預后不完全取決于臨床分期。成人T細胞淋巴瘤從免疫表型來說是來自成熟的T細胞，但臨床表現很兇險像來自不成熟T細胞的淋巴母細胞淋巴瘤。這些，都有待進一步研究特別是不同基因在其中的作用。
2.霍奇金淋巴瘤的發病機制 絕大多數經典霍奇金淋巴瘤患者伴有克隆性細胞遺傳學異常，這種異常隨不同病例而不同，且克隆內異常也為異質性，提示染色體不穩定。許多病例顯示14q異常類似B細胞性淋巴瘤，但很少發生t(14；18)的異常。2個研究組應用熒光原位雜交技術(伴或不伴熒光免疫分型)，發現所有霍奇金淋巴瘤病例的RS細胞顯示克隆數值異常。早期報道中，約1/3的霍奇金淋巴瘤中發現Bcl-2重排，但其他實驗室未檢測到Bcl-2重排。而且，在高反應性組織中如反應性扁桃體中也發現Bcl-2重排。與EBV有關的轉化蛋白能夠上調培養細胞中的Bcl-2，這一證據進一步表明Bcl-2表達與霍奇金淋巴瘤之間的關系。Bcl-2過度表達的免疫組化研究得到的結論并不一致。但是Bcl-2表達似乎與組織學EBV(+)或t(14；18)易位無關，Bcl-2表達的增強可能存在于背景細胞，并且對霍奇金淋巴瘤的發病不起重要作用。但一個研究組應用細胞遺傳學分析法，明確證實了腫瘤細胞存在Bcl-2重排，而不發生t(14；18)最近在霍奇金淋巴瘤中發現新的凋亡抑制因子Bcl-X(L)94%的霍奇金淋巴瘤中Bcl-X(L)為陽性，且大多數RS細胞為高強度表達。在非霍奇金淋巴瘤中表達率低(＜20%)，但網狀中心淋巴瘤除外故推測，Bcl-X(L)在RS中的異常表達對于凋亡的抑制可能是霍奇金淋巴瘤的發病原因。未發現Bcl-X(L)與EBV表達存在相關性經免疫組化分析，在CD30+ 的霍奇金和其他淋巴瘤中已檢測到P53抑癌基因表達但是最近的研究發現，在8例霍奇金淋巴瘤中霍奇金和RS細胞都無P53突變。
最近Humboldt等報道，從HL病人淋巴結活檢樣本中IκBα mRNA在HRS細胞中過度表達，并檢測到IκBα基因突變，產生C端截斷的蛋白質，推測此蛋白質不能抑制NF-κB-DNA結合活性而防止HRS細胞凋亡，并引發增殖。因此與HL發病有關。
NLPHL的細胞遺傳學資料很少，而且細胞遺傳學異常的研究結果也不一致。Tilly等報道的大系列HL中只有1例NLPHL,此例NLPHL具有46XY核型。Hansmann等報道了1例高二倍體NLPHL，6q-，+2l，及幾個未明確的標志研究發現，起源于NLPHL的DEV細胞系列具有下述核型異常：48，XXY，t(3；14)(3；22)，t(3；7)，del3-2+12，+mar。分析HL的倍體情況，5例NLPHL中3例為非整倍體，未檢測到四倍體而四倍體常見于經典HL。Bcl-2基因重排只在一小部分病例中檢測到，應用免疫組化檢測Bcl-2蛋白表達陽性病例數很少據此推測，Bcl-2轉位可能對NLPHL發病不起重要作用
腫瘤細胞的起源長期以來一直認為HL中不同組織學類型代表同一疾病的形態學變異，其中HRS細胞處于反應性背景中而每一組織亞型均有特征性細胞組成。在過去20年中人們逐漸發現上述概念只是部分正確，如結節性淋巴細胞為主型HL與HL的其他類型不同，是不同的生物學疾病。
(1)經典HL中HRS的細胞起源：最早有關HRS表達Ig的免疫組化研究如1974年Garvin等及隨后Taylor等，他們的研究證實在HL活檢標本中可獲得HRS表達IgG的結果，表明HRS起源于產生Ig的B細胞，但是其他免疫組化研究顯示HRS起源于非淋巴系細胞。其后直到單克隆抗體技術的應用，發現了CD30分子證明經典HL的HRS選擇性表達CD30，而正常個體只在一些活化的淋巴母細胞中表達這一資料首次證明HRS為淋巴細胞起源基因水平研究表明，HRS發生克隆性Ig基因重排，在Rajewsk系列中13例HL中檢測到12例，stein也報道25例中檢測到24例發生重排，證明95%的HLs為B細胞起源。序列分析證明，在重排的V區具有高負荷的體細胞突變。由于一些經典HLs的HRS細胞表達1或多個T細胞抗原以及40%的HL中的細胞系列具有T細胞表型和基因型，故推測剩余的5%經典HL起源于轉化的T細胞。但由于在HRS細胞中還未檢測到重排的TCR基因，這一推測無法證實。最近的研究發現，經典HL起源于生發中心B細胞而不是生發中心后B細胞；B細胞系子代可發生2種獨立的轉化，一種形成HRS細胞另一種形成NHL；產生HL的轉化完全改變了普通祖細胞的形態學和免疫表型(不表達CD20CDl0，Bcl-6和IgM并下調突變機制，表達CD30和CD15)而轉化為NHL的細胞或多或少保留了B細胞系祖先的特征。某一特定病例中的HRS細胞群體完全起源于單個轉化細胞，并克隆增殖。WHO(2001)分類中認為結節性淋巴細胞為主型霍奇金淋巴瘤起自生發中心母細胞分化階段的B細胞，而經典型霍奇金淋巴瘤98%起自生發中心分化階段中的成熟B細胞。
(2)NLPH中淋巴細胞和(或)組織細胞(H＆L)的細胞起源：淋巴細胞為主型HL，是特征性的腫瘤細胞[(淋巴細胞和(或)組織細胞(H＆L))的亞型，與進行性轉化的生發中心的巨大結節有關免疫組化研究表明H＆L細胞是B細胞系列。因為它們表達大量B細胞標志包括CD19CD20，CD22，CD79a和J鏈，且最近的分子學研究也提示：H＆L細胞是轉化的中心母細胞。在主要的克隆群體中，免疫球蛋白重鏈持續發生體細胞高突變。在發達國家，EBV很少與H＆L細胞有關聯可能與本病發病無關。H＆L細胞常被CD3+,CD4+,CD57+,CD40,L-的T細胞圍繞，但此T細胞玫瑰花結的意義尚不清楚。NLPHL可能與大細胞淋巴瘤共同發生或轉為大B細胞淋巴瘤。大量研究表明至少在一些病例中，B-DLCL和NLPHL在克隆上存在相關性。NLPHL也可具有與富組織細胞B細胞淋巴瘤(HRBCL)相似的結節或大塊區域，至少某些HRBCL病例起源于NLPHL富T細胞B細胞淋巴瘤(TCRBCL)也可能存在上述情況。有關NLPHL細胞基因方面的資料很少，且各研究組所報道的細胞基因異常也不一致。
(3)細胞因子：霍奇金淋巴瘤的主要組織學特征為：相當數量的膠原硬化、炎癥細胞和惡性RS細胞。而RS細胞及背景細胞產生的細胞因子導致了各亞型上的區別。在這些細胞之間有復雜的旁分泌和自分泌作用。RS細胞和反應性細胞產生的各種細胞因子既影響RS細胞又影響周圍細胞環境。例如轉化生長因子-β1，(TGF-β1)mRNA在結節型霍奇金淋巴瘤的嗜酸性粒細胞中已被測到。盡管TGF-β1的作用決定于它與其他因子和靶細胞的相互作用，但它可以刺激纖維母細胞增生并產生膠原，可能對膠原的形成起著重要的作用，后者是結節型霍奇金淋巴瘤的特征。對本病的發病起重要作用的另一細胞因子是IL-5。IL-5是嗜酸性粒細胞的生長因子而嗜酸性粒細胞在一些霍奇金淋巴瘤中是主要的背景細胞，在RS細胞中也發現了IL-5mRNA。此外，RS也分泌IL-1，IL-9，腫瘤壞死因子-α，粒細胞-巨嗜細胞克隆刺激因子和巨嗜細胞刺激因子IL-6存在于l0%～60%的RS細胞中，它可誘導漿細胞增生并能促進淋巴細胞增生和成熟。霍奇金淋巴瘤的不同組織學特征可能是RS和反應性背景細胞如T淋巴細胞、組織細胞和嗜酸性細胞分泌的多種細胞因子網絡的結果。