臨床數據表明他克莫司能透過胎盤。來自接受器官移植的妊娠患者的有限數據表明，本品與其他免疫抑制藥物相比，并未增加妊娠過程和結局不良反應發生的風險。到目前為止，還沒有其他相關流行病學資料。孕婦因治療需要，如果沒有其他更安全的療法并且只有在母體潛在的益處大于對胎兒的潛在風險時，才可以使用本品。如果在子宮內有藥物暴露，建議監測他克莫司對新生兒潛在的不良反應(特別是對腎臟的作用)。新生兒可能發生早產(<37周)和高鉀血癥的風險，但高鉀血癥能自行恢復正常。
在大鼠和兔的實驗中，他克莫司在母體毒性劑量下引起了胚胎毒性。他克莫司可影響雄性大鼠的生殖能力。
臨床數據表明，他克莫司能分泌入乳汁。因不能排除對新生兒的不利影響，服用本品的婦女不應哺乳。