近年來質譜儀性能的顯著改進主要基于開發出的兩種離子化技術：一種是介質輔助的激光解吸/離子化技術。另一種是電噴霧離子化技術。由于這兩種電離技術的出現，使原本只能檢測小分支的質譜技術，可以運用于檢測生物大分子。
在過去質譜技術主要運用于對一級結構和序列的表征，而現在質譜技術越來越多地運用于高級結構的分析，而高級結構對于抗體藥物的生物活性至關重要。
隨著抗體藥物的不斷發展，需要對于抗體藥物的結構信息不斷進行深入的分析，質譜技術也隨著這一要求不斷進步。隨著技術的進步，可以預見質譜分析會越來越多地運用于抗體分析中，特別是在高級結構分析的領域，通過質譜分析，可以讓我們更多獲得高級結構的信息，這對于抗體藥物的分析是極為重要的。本文涵蓋了與現代質譜實踐相關的廣泛主題，并回答了有關質譜儀使用和功能的一些常見問題。
質譜簡史
1897年—現代質譜（MS）歸功于英國曼徹斯特JJ Thomson的陰極射線管實驗。
1953年—沃爾夫岡·保羅（Wolfgang Paul）發明的四極和四極離子阱為他贏得了諾貝爾物理學獎。
1968年—馬爾科姆·多爾（Malcolm Dole）開發了當代電噴霧電離（ESI）。在真空中產生氣溶膠會產生蒸氣，這種蒸氣被認為很難實用。液體的體積增加了其冷凝相的100到1000倍（標準條件下1 mL/ min的水將產生1 L / min的蒸汽）。
1974年—Horning在很大程度上基于氣相色譜（GC）技術開發了大氣壓化學電離（APCI），但并未廣泛采用。
1983年— Vestal和Blakely加熱液體流的工作被稱為熱噴涂。它成為當今商業上適用的工具的預兆。
1984年—芬恩在ESI的工作發表，使其在1988年獲得諾貝爾獎。
為什么要使用質譜分析？
醫藥工業領域的工作人員在進行藥物研發和藥物開發時需要利用MS的特異性、動態范圍及其靈敏度，區分復雜基質中緊密相關的代謝物，從而鑒定并量化代謝物。尤其是在藥物的開發過程中，藥物需要進行相應的鑒定、純化，確定早期的藥代動力學，MS已經證實是不可或缺的工具。
生物化學家擴展了MS的使用領域，將其應用到蛋白、肽和寡核苷酸的分析中。使用質譜儀，生物化學家們能夠監測酶的反應，確定氨基酸序列，并通過包含有蛋白裂解片段衍生物樣品數據庫鑒別大分子蛋白。生物化學家通過氫－氘交換在生理條件下形成重要的蛋白-配體的復合物，監測蛋白質的折疊。臨床化學家在藥物檢測和新生兒篩查中也應用MS，取代結果不確定的免疫分析。食品安全和環境研究人員也是這樣。他們跟行業中相關的企業工作人員一樣，也使用MS，比如：PAH和PCB分析，水質量分析，及食品農藥殘留分析。確定油組成是一項復雜且昂貴的工作，這刺激了早期質譜儀的發展，并不斷推動該技術的繼續創新。現今，MS的專業人員可以在各種質譜儀、一系列完善可靠的電離技術中進行選擇。
你在考慮使用質譜儀（MS）之前，應當考慮一下這些問題：您分析的是蛋白質、肽等大分子，還是獲取水溶性小分子的數據？您是在尋找目標化合物，還是表征未知樣品？針對復雜基質，您當前的分離技術能到達所需要的純度嗎，或者您必須開發新的純化方法？您要求單位質量精度（比如400 MW），或5ppm的質量精度（比如，400.0125 MW或質量為400時準確度為2mDa）？這些問題都是應該有所考慮的。
什么是質譜？質譜是怎樣工作的？