質譜作為液相色譜的檢測器與紫外和二極管陣列檢測器相比較，兼有鑒定功能和靈敏度高的特點。
所以近些年來HPLC-MS己經成為藥物分析方面的有利工具。近幾年用HPLC-MS對各種藥物尤其是違禁藥物及其代謝產物的研究國內外有大量的文獻報道，如尿中的河豚毒素、抗生素、舒喘寧和血液中的安非他明、奧美拉唑、羅呱卡因、氨磺必利、前列腺素EZ以及艾滋病病毒等痕量殘留的分析。
可以預測，隨著對HPLC-MS研究的深入和該技術應用的普及，HPLC-MS技術將成為藥物和保健食品中違禁成分分析中發揮更大的作用。
