在日用化學和食品工業中,使用核磁測量物質的含水量和含油量以及其它性質。在藥學中可以用它分析各種中藥和西藥的結構。
核磁共振技術在活性藥物化合物的篩選方面有著巨大的潛力,尤其在基于靶分子的篩選能夠節省大量的時間和費用及其發現活性化合物方面的有效性是其它方法所不可替代的。
核磁共振技術在體內藥物分析中也有較廣泛的應用,具有簡便性、無損傷性、連續性、高分辨性等優點。