目前常用的液相色譜與質譜聯用具有兩大分類系統，一種是從質譜的離子源角度來劃分，包括電噴霧離子源﹙ESI﹚，大氣壓化學電離源﹙APCI﹚，大氣壓光電離源﹙APPI﹚和基質輔助激光解吸電離源﹙MALDI﹚等，另一種是從質譜的質量分析器角度來劃分，包括四極桿、離子阱、飛行時間﹙TOF﹚和傅立葉變換質譜等。
ESI、APCI和APPI三種離子源大多與四極桿和離子阱質譜聯用，是目前應用最廣泛的幾種液質聯用儀。
