1、紅外非活性振動，高度對稱的分子，由于有些振動不引起偶極矩的變化，故沒有紅外吸收峰。
2、不在同一平面內的具有相同頻率的兩個基頻振動，可發生簡并，在紅外光譜中只出現一個吸收峰。
3、儀器的分辨率低，使有的強度很弱的吸收峰不能檢出，或吸收峰相距太近分不開而簡并。
4、有些基團的振動頻率出現在低頻區（長波區），超出儀器的測試范圍。
