1.真兩性畸形
根據社會性別的心理發展及病人和家屬的意愿取舍為主，根據性腺、性器官的優勢取舍為次。如作為男性，則應切除卵巢組織、輸卵管、子宮和增大的乳房，陰道可不予處理。作女性者，需切除睪丸組織，肥大的陰蒂行修復術。到青春期后再根據性別應用性激素治療。
2.假兩性畸形
（1）男性假兩性畸形確定性別以年齡越小越好，一般2～3歲為宜。男性外生殖器型作男性最佳，原則上只需性陰莖矯直及尿道成形術。似男非男型主要根據陰莖和睪丸的發育情況、社會性別、家屬及患者意愿而定。睪丸女性化型社會性別多為女性，多數乳房已發育，可行兩側睪丸切除并作陰道成形術。
（2）女性假兩性畸形需糖皮質激素終身替代治療，調整劑量以維持24小時尿-17酮類固醇于正常水平，可促進月經來潮，乳房發育，體毛相應減少，皮膚逐漸細膩，面部清秀等。肥大陰蒂需行陰蒂陰唇整復術及陰道外口增寬術等。