病因未明，多數學者認為與柯薩奇B病毒等感染有關。發病前常有上呼吸道感染病史。由于遠端回腸的淋巴引流十分豐富，回腸、大腸區淋巴結多。上呼吸道感染或腸道感染后，病毒、細菌及其毒素沿血循環到達該區淋巴結，引起腸系膜淋巴結炎。病毒感染者表現為腸系膜淋巴結增生、水腫、充血，但培養為陰性。沙門菌感染引起的腸系膜淋巴結炎不同于病毒性淋巴結炎，細菌侵襲的淋巴結多表現為淋巴結內急性炎癥反應、出血及壞死，淋巴結內可分離出沙門菌。
