結腦常為全身性粟粒性結核病的一部分,通過血行播散。嬰幼兒中樞神經系統發育不成熟、血腦屏障功能不完善、免疫功能低下與本病的發生密切相關。結腦亦可由腦實質或腦膜的結核病灶破潰,結核菌進入蛛網膜下腔及腦脊液中所致。偶見脊椎、顱骨或中耳與乳突的結核灶直接蔓延侵犯腦膜。