預雜交液的制備:根據要雜交的膜的數量配制預雜交液,每25 ml預雜交液(1~2張膜)的成分組成如下:
| H2O | 15 ml |
| 20×SSPE | 6.25 ml |
| 50×Denhardt | 2.5 ml |
| 10% SDS | 1.25 ml |
| 100 mg/ml鮭魚精DNA(緩加) | 400 ml |
1 取適量小麥基因組DNA,用適量的限制性內切酶消化完全(約5 U/mg DNA,酶切12 h左右),取少量電泳檢測酶切完全性;然后依次用酚:氯仿和氯仿:異戊醇抽提,乙醇沉淀。而后溶解在20 ml TE Buffer中;
2、在1%的瓊脂糖凝膠上電泳10~12 h,電壓為3 V/cm;
3、電泳完畢后,將膠轉入EB染色液中,染色10 min,紫外燈下檢測酶切結果;
4、將膠轉入500 ml 0.25N的HCl中,脫嘌呤15~30 min,直至溴酚藍變黃,用水洗一下;
5、0.4 N的NaOH處理20 min。與此同時,尼龍膜在超純水中潤濕后,在0.4 N的NaOH中泡5 min以上;
6、將凝膠翻轉后放在濾紙橋上,放上一張與凝膠大小相當的尼龍膜(Hybond-N+,Amarsharm),趕除氣泡,在膜上放3層濾紙,與尼龍膜大小相同,趕除氣泡,將凝膠周圍用膠片封好,放上大小相當的吸水紙,壓上約500
g的重物,轉膜10 h以上,其間更換吸水紙;
7、標記點樣孔一角,然后放在2×SSC中浸泡10 min,并進行輕微震蕩。用濾紙吸干,保鮮膜包好,置4 ℃存放備用;
8、利用HYBAID固相雜交儀進行預雜交、雜交。雜交瓶中根據膜面積大小,加入10~20 ml預雜交液,預熱到65 ℃,然后放入尼龍膜。65 ℃,預雜交5~6 h;
9、采用Takara公司Random primer DNA labeling kit進行探針標記,取適量待標記的DNA片段和Random
primer 2 ml,加入ddH2O至終體積14 ml,95 ℃變性3 min后立即冰浴5 min,瞬時離心。然后在此管中,依次加入:
| 10×buffer | 2.5 ml |
| dNTP Mixture | 2.5 ml |
| Klenow 酶 | 1 ml |
| α-32P-dCTP | 5 ml |
輕輕混勻,37 ℃反應30 min~1 h。然后65 ℃反應5 min,95 ℃反應3 min后迅速置于冰上冷卻;
10、將變性后的探針加到預雜交液中,繼續于65 ℃雜交約12 h; 11、用2×SSC/0.5% SDS洗膜液于65 ℃洗膜15 min,重復1次。然后,再用0.2×SSC/0.5% SDS洗膜液于65 ℃洗膜15 min,重復1次;
12、檢測雜交信號與背景情況,直至探測器探測的信號為10個counters左右,用濾紙吸干雜交膜,用保鮮膜包好,壓磷屏;
13、尼龍膜可以反復進行分子雜交,去除尼龍膜上原雜交探針的方法如下:將0.1×SSC/0.5% SDS洗液加熱到100
℃,放入雜交膜,在大于95 ℃條件下洗5 min,重復3次,將洗好的雜交膜放入2×SSC中漂洗5 min,濾紙吸干,保鮮膜包好,4 ℃存放。