帕-羅二氏綜合征僅在初期需與下列疾病鑒別：
1.先天型脂肪營養不良（congenital lipodystrophy）：又稱Lawrence-Seip綜合征。本病主要表現軀體、四肢或面部散在分布脂肪萎縮，常染色體隱性遺傳。起病于嬰兒期，常并發外陰部肥大、多汗、頭部多毛癥、黑色棘皮癥。后期發展為糖尿病，可出現肝、腎功能不全或心肌肥大，以及合并肢端肥大癥等。
2.局限性硬皮癥：疾病初期可能產生混淆，但頭面部并非硬皮癥好發部位，而皮膚硬皮癥與下面組織粘連甚緊不易捏起，也無刀痕式分布可幫助鑒別。
尚需與脊髓空洞癥、肌萎縮側索硬化癥、肌營養不良等疾病相鑒別。