分子生物學軟件介紹
一、實驗準備階段
Reference Manager 9.0
Endnote 3.1.2
二、實驗實施階段
1、綜合軟件
Omiga 2.0
DNASIS 2.5
DNATools 5.1
2、限制酶切位點分析
DNAssist 1.0
3、引物設計
Primer Premier5.0
4、序列的同源比較
GeneDoc 3.2
MACAW 2.05
Clustal X
5、質粒繪圖
Gene Construction Kit 2.0
Plasmid Premier2.02
6、結構域(motif)查找
Primer Premier 5.0
7、RNA二級結構預測
RNAdraw
RNAStructure 3.5
8、蛋白二級結構分析
Antheprot 4.5
9、三維結構顯示
RasMol 2.7.1
Cn3D
10、格式轉換
Seqverter 1.3
11、電泳圖譜分析
band leader 3.0
三、實驗結果輸出階段
1、生成出版質量的圖片
Pov-Ray for Windows 3.1
molmol 2.5.1
2、向數據庫遞交序列
Sequin 2.90
Digest
PCMolecule
Pcrare
Redsoft Plasmid
Redasoft Plasmid
TreeView
基因組大片段的精準操控是作物育種和合成生物學領域的關鍵需求。CRISPR-Cas系統依賴DNA雙鏈斷裂(DSB),大片段重排效率低且易產生副產物。經典重組酶識別序列固定、無法重新編程。近年,bridg......
近日,中山大學腫瘤防治中心主任醫師牟永告團隊聯合廣東省科學院生物與醫學工程研究所醫學材料團隊郭會龍副研究員等科研人員,開發出一種三重響應型可注射水凝膠,可在術后瘤腔實現siRNA靶向遞送,從而阻斷腫瘤......
美國梅奧診所團隊在新一期《臨床研究雜志》發表報告稱,癌細胞會借助一種名為TRAILshort的蛋白,巧妙關閉人體的免疫反應。這一突破有望催生全新的癌癥療法,或提升現有免疫療法的效力。約15年前,團隊在......
近日,中國農業科學院植物保護研究所聯合多家科研單位,成功研發出以RNA干擾為核心的根結線蟲綠色防控技術,相關研究成果發表在《現代農業化學》(AdvancedAgrochem)上。根結線蟲是嚴重危害糧食......
美國弗吉尼亞理工大學科學家團隊開發出一種名為“RNAbpFlow”的AI模型,在RNA結構預測任務中的表現可媲美谷歌旗下“深度思維”公司開發的“阿爾法折疊3”,且無需依賴海量進化序列數據庫,有望加速R......
近日,中國農業科學院作物科學研究所野生稻保護與利用創新研究組聯合國內外科研團隊系統解析了水稻長鏈非編碼RNA的多組學特征與表型效應,揭示了其驅動表型變異與育種潛力。相關研究成果發表在《細胞研究》(Ce......
中國科學院動物研究所研究員趙方慶團隊開發基于納米孔RNA直接測序技術與深度學習策略的RNA修飾圖譜解析算法ORCA。相關研究發表于《自然-通訊》。基于深度學習的RNA修飾系統識別與注釋模型 ......
現代生命離不開三樣東西:DNA、蛋白質和RNA。但問題是,它們不可能同時出現。蛋白質就像建筑工人和建筑材料,沒有蛋白質,DNA無法復制;DNA就像建筑藍圖,沒有DNA,蛋白質無法構建。為了解開這個“先......
從低水平定量到識別日益增長的新型PFAS化合物及其代謝物,種種挑戰引發了人們對漏檢新興關注變體的擔憂,實驗室需要配備多種PFAS檢測能力,專注于已知目標物、未知物的可靠鑒定以及新興威脅的分析。強大且易......
在人類中,活到百歲已是長壽,而在鯨類中,這個歲數還算“年輕”,因為該家族中的弓頭鯨有時能活200多年。但沒人知道弓頭鯨長壽的原因。一項10月29日發表于《自然》的研究發現,弓頭鯨能夠活數百年且不患癌癥......