一般幽門梗阻的病人不宜施行緊急手術，如經過3～5天胃腸減壓，病人能恢復飲食，病情逐漸好轉，說明痙攣和水腫的因素得到消除，可繼續觀察。必要時重復鋇餐檢查。如減壓無效則說明為瘢痕性狹窄，必須采取手術治療。如有惡性腫瘤的證據，無疑須積極采取手術措施。
1.內科治療
矯正失水與電解質紊亂是治療幽門梗阻的首要問題，因為丟失胃酸多，存在不同程度的堿中毒。因此入院后可以先給生理鹽水，待尿量增加，便需加入氯化鉀溶液。低鉀性堿中毒嚴重者甚至每天應補充氯化鉀。水分的補充則用5%～10%葡萄糖溶液。按每天基礎需要量2500ml計算，外加每天從胃管吸出的量和失水量的一部分。因此每天輸入液體量，除按血生化測定結果輸入適量的電解質溶液外，不足水分以葡萄糖液補充。其次，使擴張的胃經持續減壓得到復原。炎癥水腫消失使胃壁肌層的張力得以恢復。如梗阻為幽門痙攣或黏膜水腫所致，則于梗阻消除后，按潰瘍病調節飲食和相應的藥物。
2.外科治療
經短期內科治療無效，說明瘢痕攣縮為引起幽門梗阻的主要因素。或經檢查診斷為胃潰瘍，尤其是有惡變可疑者，于非手術療法使炎癥水腫消失后，應擇期行手術治療。既往所采用的單純引流術，如幽門成形術或胃空腸吻合術，不能解決潰瘍病的問題。因此現在普遍施行胃切除術或迷走神經切斷術，后者以選擇性或高選擇性迷走神經切斷術為主，而迷走神經干切斷術已很少應用。選擇性迷走神經切斷術加胃竇切除術，并作胃十二指腸吻合，曾經被認為是治療幽門梗阻最好的手術。但有時十二指腸不易游離，則作選擇性迷走神經切斷術加胃竇切除術，而后行胃空腸吻合術。近來主張作高選擇性迷走神經切斷術而不加幽門成形術者較多。如果潰瘍位于幽門部的前壁，在作幽門成形術時應將潰瘍切除；但若潰瘍是在后壁，則幽門成形術不能同時切除潰瘍，只有行胃竇切除才能切除潰瘍，或將潰瘍曠置。總之，為幽門梗阻施行手術，首要任務是解決梗阻，其次是根治潰瘍病。究竟哪種術式效果好，主要應根據病情來考慮：病人的年齡、全身情況、胃酸的高低、胃炎的程度，以及潰瘍所在位置。如病情不允許作復雜手術，可選擇簡單引流手術，以解決當務之急。