醫生將一根1米余長的活檢鉗從胃鏡鏡身內的一個專用孔道插入。活檢鉗為特制的專用鉗,一端是鉗口,另一端是開閉裝置,通過細鋼絲控制鉗口閉合與啟開。鉗口的大小是經過精心研究后設計的,只能咬到胃粘膜而對胃壁無明顯損傷。為了診斷更加準確,可能要取2塊以上的組織,并放入盛有保存液的小玻璃瓶中保存。病理科的醫生再將所取組織塊切成更薄的切片,通過染色等加工后即制成人們所見的病理玻片,然后通過顯微鏡觀察有無幽門螺桿菌特征等。