嵌合成分來自不同的受精卵所產生的嵌合體。和同源嵌合體一樣，嵌合成分可以包含不同的染色體或不同的基因。少數異源嵌合體是天然的，例如蜜蜂的雌雄嵌合體由一個二倍體受精卵（一般發育成為雌體）和一個未受精的單倍體極核（一般發育成為雄體）并合后發育而成，桑蠶中的雌雄嵌合體則是由一個受精卵和一個受精的極體并合后發育而成。多數異源嵌合體為人工構建，構建方法有嫁接、胚胎并合、移植等。
整體嫁接 高等植物中取得異源嵌合體的常用方法。一般將接穗和砧木的愈合部位橫截為二，在斷面上形成的愈傷組織常能分化并長出新芽。凡是具有嫁接雙方特征的新枝都是嵌合體。如果外層組織原層來自嫁接一方，其余原層屬于嫁接另一方則發育為周緣嵌合體；如果全部組織原層有一個區段為一方，其余的為另一方便發育為扇形嵌合體；如果某一層的一部分為一方，其余為另一方，或是雙方組織在構成組織原層時相互鑲嵌,便發育為周緣區段嵌合體，如果雙方組織在空間位置上呈不規則分布便成為花斑嵌合體。
組織并合 1972年P.S.卡爾森等將栽培煙草（Nico－tiana tabacum) 和雜種雙倍體煙草（N.glauca ×N.Langsdorfii）的髓組織緊貼培養，挑選有雙方特征的嵌合體組織塊繼代培養，可使之分化成為嵌合體小植株。將不同基因型的愈傷組織塊緊貼培養，或以酶處理使雙方愈傷組織細胞解離后相互混合，再行培養后也能得到類似結果。
胚胎并合 1967年美國學者B.明茨從純系黑鼠和純系白鼠的輸卵管中分別取出8細胞期到桑椹期的胚胎，在試管內用蛋白酶去除透明帶，使兩個幼胚緊密接觸并融為一體，在體外繼續培養到胚泡階段，然后移植到經孕激素處理的母鼠子宮內，所獲得的皮毛黑白混生的嵌合體小鼠稱為異表型嵌合體。
移植 用射線照射使受體哺乳動物失去免疫特異性，然后將具有正常活力的另一基因型的供體骨髓細胞植入受體的骨髓中，受體內兩種基因型的漿細胞有時能夠長期存活而構成漿細胞嵌合體。