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1. 依次加入下列試劑,建立用以標記引物的反應混合液(終體積10 μl)
(1)2.5 μl H2O (2)1 μl 10×T4多核苷酸激酶緩沖液 (3)1 μl 0.1 mol/l DTT (4)1 μl 1 mol/l 亞精胺 (5)1 μl 50~100 ng/μl 掛核苷酸引物 (6)3 μl 10 μCi/μl[γ-32P]ATP (7)0.5 μl 20~30 U/μl T4多核苷酸激酶 (8)37℃溫育1 h。 2. 加入2 μl 0.5 mol/l EDTA和50 μl TE緩沖液終止反應,于65℃溫育5 min。 3. 用硅化過的1 000 μl 吸頭塞上玻璃棉作成一小離子交換拄,加入20 μl AG 50W-X8樹脂和100 μl DE-52樹脂,以1 ml TEN緩沖液洗柱。 4. 將步驟2的標記反應物加入柱子,收集流出液重復上柱。 5. 用1 ml,TEN100緩沖液洗柱,然后以0.5 ml TEN300洗,棄洗脫液。 6. 以0.4 ml TEN600緩沖液洗脫標記寡核苷酸引物,收集流出液,在有合適屏蔽的容器中保存于-20℃備用。 7. 取RNA樣品在微量離心管中將下列物質混合(終體積15 μl): (1)10 μl 細胞總RNA (2)1.5 μl 10×雜交液 (3)3.5 μl 放射性標記寡核苷酸 (4)確保微量離心管密封,并將其淹沒在65 ℃水洛中90 min,取出在空溫中慢慢冷卻。 8. 在冰浴的微量離心管中加入以下延伸反應混合液(終體積每個RNA樣品30.33 μl): (1)0.9 μl 1mol/l Tris·Cl緩沖液,pH8.3 (2)0.9 μl 0.5 mol/l MgCl2 (3)0.25 μl 1 mol/l DTT (4)6.75 μl 1 mg/ml 放線菌素D (5)1.33 μl 5 mmol/l 4dNTP混合液 (6)20 μl H2O (7)0.2 μl 25 U/μl AMV反轉錄酶 9. 在含有RNA及寡核苷酸的微量離心管中,加入30 μl 上述延伸反應混合物,42℃溫育1 h。 10. 在毎個微量離心管中加入105 μl RNA酶反應混合物,于37 ℃育15 min。 11. 加入15 μl 3 mol/l 乙酸鈉和150 μl 酚/氯仿/異戊醇抽提,將上層水相移入一個干凈管子中,再加入300 μl 乙醇沉淀DNA,沉淀物以100 μl 70%乙醇洗滌,用吸管吸去微量的乙醇殘余,沉淀晾干5~10 min。 12. 用5 μl 終止/加樣染料液重溶沉淀,65℃水浴加熱5 min,在9%丙烯酰胺/7 mol/l 尿素凝膠中電泳至溴酚藍到達凝膠的底部。 13. 干燥凝膠并用增感屏放射自顯影。
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