鑒別診斷
（一）細菌性痢疾是由痢疾桿菌引起的常見急性腸道傳染病，以結腸化膿性炎癥為主要病變，有全身中毒癥狀、腹痛、腹瀉、里急后重、排膿血便等臨床表現。典型菌痢有高熱、腹痛腹瀉、瀉膿血便。腹痛在下腹或左下腹，左下腹明顯壓痛，且有腸索，伴明顯里急后重。糞檢有較多膿細胞、吞噬細胞。重者常脫水。這都有利于和本病區別。
（二）其它細菌所致腹瀉，如鼠傷寒、致病性大腸桿菌、耶氏菌、親水氣單胞菌，其他厭氧菌等，單從臨床有時很難鑒別。懷疑時應依靠病原學和血清學來確診。
急性細菌性痢疾：急性細菌性痢疾（急性菌痢）是感染性腹瀉最常見的原因。主要在夏秋季發病。可行成大、小流行。潛伏期多為1～2天，長可達7天。患者常以畏寒、發熱和不適感急驟起病，有腹痛、腹瀉，排便每天10余次至數十次。常伴里急后重、惡心、嘔吐與脫水。糞便在病初可為水樣，以后排出膿血便或黏液血便。鏡檢可見大量紅、白細胞，糞便培養可培養出痢疾桿菌。
中毒型菌痢以兒童多見或年齡較大，體質衰弱，營養不良者。中毒型菌痢有時以高熱、抽搐等毒血癥癥狀為主要表現。需以棉拭子由肛門取糞便進行鏡檢或細菌培養常可明確診斷。
病毒性胃腸炎：病毒性胃腸炎的主要表現為兒童或成人的夏季流行性、無菌性腹瀉。臨床特點是高度傳染性和極低的病死率，有輕度的發熱、不適感、惡心、嘔吐與稀便等癥狀。
（三）腸道外感染者須與沙門氏菌病及布氏菌病鑒別。
沙門氏菌病也成為副傷寒，副傷寒甲、乙、丙是分別由副傷寒甲、乙、丙三種沙門菌所致的急性傳染病。副傷寒甲、乙的癥狀與傷寒相似，但一般病情較輕，病程較短，病死率較低。副傷寒丙的癥狀較為不同，可表現為輕型傷寒，急性胃腸炎或膿毒血癥。
布氏菌病臨床表現非常復雜，因此分型困難。根據1977年我國北方防治地方病領導小組辦公室頒發的“人布氏菌病的診斷和治療效果判定試行標準”，臨床分型為急性期、慢性期活動型及慢性期相對穩定型。潛伏期7～60天，平均2周，少數患者可達數月至1年以上。
并發癥
有報道格林-巴利綜合癥常發生在空腸彎曲菌感染之后，認為是GB的病因之一。其發病原理可能與免疫反應有關。①細菌與神經纖維的鞘磷脂有類屬抗原，可發生交叉免疫；②腸毒素與神經節苷脂結合；③細胞介導免疫損傷。
病程中可并發腸系膜淋巴結炎、闌尾炎、膽囊炎或敗血癥。
格林巴利綜合癥是常見病，多發病。它指一種急性起病，一組神經系統自身免疫性疾病。以神經根、外周神經損害為主，伴有腦脊液中蛋白-細胞分離為特征的綜合征。又稱格林巴利綜合征。任何年齡和男女均可得病，但以男性青壯年為多見。
任何病原體如細菌、病毒、原蟲、立克次體或真菌都能引起淋巴結炎。全身性感染受累的淋巴結可以是全身性的；局部引流區的感染受累的淋巴結限于局部。
腸系膜淋巴結炎于1921年由Brenneman首先報道，因此又稱為Brenneman綜合征，又名咽喉病毒感染伴腸系膜及腹膜后淋巴結炎。是指由于上呼吸道感染引起的回腸，大腸區急性腸系膜淋巴結炎。
闌尾炎指闌尾由于多種因素而形成的炎性改變。它是一種常見病，其預后取決于是否及時的診斷和治療。早期診治，病人多可短期內康復，死亡率極低（o.1%一0.2%）；如果延誤診斷和治療可引起嚴重的并發癥，甚至造成死亡。闌尾炎是一種常見病。臨床上常有右下腹部疼痛、體溫升高、嘔吐和中性粒細胞增多等表現。闌尾炎是闌尾的炎癥，最常見的腹部外科疾病。
膽囊炎是細菌性感染或化學性刺激（膽汁成分改變）引起的膽囊炎性病變，為膽囊的常見病。在腹部外科中其發病率僅次于闌尾炎，本病多見于35～55歲的中年人，女性發病較男性為多，尤多見于肥胖且多次妊娠的婦女。
敗血癥，是指細菌進入血液循環，并在其中生長繁殖、產生毒素而引起的全身性嚴重感染。臨床表現為發熱、嚴重毒血癥狀、皮疹瘀點、肝脾腫大和白細胞數增高等。分革蘭陽性球菌敗血癥、革蘭陰性桿菌敗血癥和膿毒敗血癥。以抗生素治療為主，輔以其他治療方法。預防措施為避免皮膚粘膜受損，防止細菌感染。