微衛星DNA(MicrosatelliteDNA)，又稱為短小串聯重復(Shorttandemrepeats,STR)或簡單重復序列(Simplerepeatsequence,SRS或SSR)，廣泛存在于原核生物和真核生物基因組中，常見的有二、三、四核苷酸重復序列，約占真核生物基因組的5%，其基本構成單元(核心序列)為1–6bp。其中最為常見的是雙核苷酸重復即(CA)n和(TG)n，人類基因組約有5×104～1×105個(CA)ｎ重復序列，占10%。每個微衛星DNA的核心序列結構相同，重復單位數目約為10～60次，其長度一般不超過300bp，多位于基因非編碼區、內含子或非翻譯區，可存在于Ａlu序列中或衛星序列中，但在編碼序列及外顯子中也可找到。微衛星DNA的高度多態性主要來源于串聯數目的不同。關于微衛星DNA多態性產生的機制，目前普遍認為是DNA復制過程中滑動或DNA復制和修復時鏈滑動與互補鏈堿基錯配，導致一個或幾個重復單位的缺失或插入。
微衛星DNA是近年來飛速發展起來的一種新型的DNA高度多態性遺傳標記系統，具有種類多分布廣泛、高度多態性、雜合性高、重組率低的特點，在群體中變異范圍大，構成了豐富的長度多態性，有高度的個體特異性，并遵循孟德爾共顯性遺傳規律，提供了眾多有高度遺傳信息的新的多態性標記。這種多態性標記已廣泛用于構建人類遺傳圖譜、法醫學親子鑒定、遺傳疾病和腫瘤發生機制的研究、疾病相關基因、疾病連鎖基因和易感基因的研究、以及疾病診斷等等。