傅里葉紅外光譜儀的具體原理：
化學成分的可視化——化學成像
化學物質的分布情況可以基于峰高、峰面積、多變量分析結果（PCR/MCR）、與目標光譜的相似度等信息進行可視化。
藥品粉末的化學成像
藥品粉末用金剛石池滾軋后進行紅外顯微mapping測量。右圖表示的是粉末不同成分（乳糖、脂質、纖維素）的分布情況。顯示的顏色可以在單色和彩色之間自由切換。
超小樣品分析——同檔次信噪比
AIM-9000專門為極小樣品的測量進行了優化。AIM-9000的信噪比可達30000:1，為同檔次。相應的，對非常小的異物，也可以很快得到高質量的譜圖。
聚苯乙烯微球的透射測量
10μm直徑的聚苯乙烯微球，透射方法測量。只需次數很少的掃描，即可得到超小樣品的高質量低噪聲光譜圖。
高靈敏度顯微ATR測量——高折射率樣品
抗反射鍍層的Ge晶體，有超過50%的高光通量，可提供高靈敏度測量。相比之前型號，有更小的紅外光入射角。AIM-9000可以對高折射率樣品，如炭黑橡膠，得到很好的無失真ATR光譜。
炭黑橡膠的ATR測量
50wt%炭黑含量的丁腈橡膠（NBR），使用Ge晶體ATR物鏡進行測量。C=C-H面外彎曲模式的峰在970cm-1附近清晰可見，而用傳統的ATR物鏡會發生變形。
全面支持異物鑒別——管道水/食品異物譜庫和塑料熱解譜庫
管道水/食品異物譜庫
該譜庫為島津獨有，特別適用于管道水和食品中的異物分析。譜庫包括構成水管道的全部商品化部件和常見異物的實測光譜及相關信息。同時，還包括了相應樣品的XRF光譜數據（PDF文件）。相應的，可以改善異物檢索的精度。不像傳統的紅外譜庫，它是真實的混合物譜庫，并且包含了定性分析所需的豐富知識和經驗。
塑料熱解譜庫*
該譜庫為島津獨有，包括了塑料熱解氧化產物的豐富光譜信息，特別適用于降解老化物質的異物分析。
電子電器
此處是電子器件端子上附著異物的分析例。利用大視野相機，觀察器件整體，決定對哪個部位進行測量。對薄的污漬或小的外來異物，反射方法譜圖質量不好時，可以考慮使用Ge晶體的顯微ATR測量。
機械和運輸
此處是長期暴露在日光下的樹脂部件分析例。通過對部件截面紅外光譜的測量，深度方向上的降解程度實現了可視化。
制藥和生命科學
此處是附著在藥片表面異物的分析例。通過挑入金剛石池中進行擠壓，可以對不同形狀的樣品進行顯微透射測量。
石油化工
此處是薄膜偏振分析的例子。利用紅外偏振片，可以評估薄膜的偏振特性和取向。