一、總則：用于培養的標本在收集時應注意嚴格無菌操作和及時送檢，檢測后標本應妥善保存。
二、臨床標本的采集
（一）下呼吸道分泌物（痰液）
令患者早上起床后用清水瀨口，不要刷牙，立即從下部呼吸道咳出第一口痰，吐在無菌塑料痰盒中，及時送檢。
（二）、尿液（中段尿）
護理人員協助采取中段尿約3ml入無菌試管中，及時送檢。
（三）、糞便：取有粘液、膿血部分的糞便置玻璃大便專用管中，如為稀水便，可直接收集于玻璃管中，及時送檢。
（四）、眼、耳、鼻、喉拭子：將棉拭子沾取少許無菌生理鹽水（如沾取的太多，可在無菌生理鹽水瓶壁上擠去多余的水份），然后采取可疑部位的分泌物，倒懸于無菌試管內,及時送檢。
（五）、膿液：用沾有生理鹽水的棉拭子沾取膿液，要盡量多取一些，然后將棉拭置于無菌試管中，及時送檢。
（六）、
1、凡懷疑菌血癥和敗血病的患者，采血培養時，應盡量在未使用抗菌素前采血，如已使用抗菌素，應盡量選擇抗菌素在體內濃度最低時采血，應在病人第二次使用抗菌素之前采集血培養標本。當然在病人發熱或寒顫時采集也可。
2、成人每次采血5—10ml，小兒采血2—3ml；
3、嚴格消毒病人采血部位和血培養瓶口，抽一定量血液后，無菌注入血培養瓶內，輕輕搖勻，
4、從抽血到接種入瓶，動作要快，防止血液凝固，同時要及時送檢。
（七）、穿刺液：胸腹水、心包液、關節腔液、鞘膜積液：
嚴格無菌抽取后，注入含肝素抗凝的無菌試管中，輕輕顛倒試管10余次，使肝素與穿刺液混勻達到抗凝的目的，或直接無菌注入血培養瓶內及時送檢。
（八）、膽汁：由專科醫生以無菌方法取引流液10ml注入無菌試管。
（九）、腦脊液：以無菌方法取腦脊液3-5ml，置無菌試管內，常溫保存送檢，如只做培養可直接無菌注入血培養瓶內，及時送檢。
（十）、生殖器官標本：陰道、子宮頸及前列腺等分泌物應由醫師采集，收集于無菌試管內送檢。如疑為淋病奈瑟菌感染，做培養檢查時，采集的標本應床旁接種并及時放入孵箱培養。
（十一）、燒傷標本：以無菌棉拭子直接采取多個部位創面的膿汁分泌物放入無菌試管中.
（十二）、支原體（解脲、人型）培養+藥敏的標本采集
1、支原體對干、熱抵抗力差，標本采集后應盡快接種支原體運送培養基送檢。
2、男性：用細的無菌棉拭子沾取無菌鹽水少許深入尿道口內2.5-3cm。
三、臨床標本的保存
細菌室標本原則上要求及時送檢、及時處理，不得保存。