在運動心臟病學中，心肺功能運動試驗一般用于確定身體素質并在運動期間識別有氧和無氧代謝，以便開出與訓練強度合適的運動處方。除此之外，心肺功能運動試驗越來越多地被用來評估心肺系統的功能限制，了解心臟或肺部手術前的運動能力，判斷康復運動計劃成功與否，判定是心臟還是肺部原因導致運動性呼吸困難，從而推導出健康受試者和患有各種疾病的患者（也包括癌癥患者（8））的預后信息。同時它還可以為運動誘發的哮喘患者提供有價值的臨床信息。有些患者希望得到身體殘疾認證從而減少工作時間和負擔，這時心肺功能運動試驗也可以用來衡量這些患者運動能力。