在甲基化分析中，亞硫酸氫鹽轉化通常是必經之路。它將未甲基化的胞嘧啶轉化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，之后再結合PCR、測序等技術分析甲基化狀態。聽上去似乎很簡單，但要想獲得漂亮的結果，卻并非那么容易。轉化效率如何?回收率如何?這都是需要考量和優化的因素。
最近，QIAGEN推出了一款新產品EpiTect Methyl II PCR Array System，無需亞硫酸氫鹽轉化，即可快速準確地檢測單個基因或一組基因的DNA甲基化狀態。
EpiTect Methyl II PCR Array System采用創新的MethylScreen技術，實現了單個基因以及疾病和通路聚焦的一組基因中CpG島DNA甲基化的快速準確檢測。此技術無需亞硫酸氫鹽轉化。通過一步簡單的限制性內切酶消化以及實時定量PCR，22個或94個不同基因的DNA甲基化水平可利用DNA Methylation PCR Array同時分析。
MethylScreen技術是由Orion Genomics公司在2007年開發的。1這種方法是基于甲基化敏感(MSRE)和/或甲基化依賴(MDRE)的限制性內切酶切割后的DNA檢測。這兩種酶分別消化未甲基化和甲基化的DNA。消化之后，通過實時定量PCR定量每個酶切反應中剩余的DNA。利用ΔCt法將每個消化產物與mock(未添加酶)對照比較，從而確定甲基化和未甲基化DNA的相對量。操作過程的簡單讓此技術高度適合DNA甲基化圖譜分析以及多個領域的生物標志物發現，如干細胞分化和發育。
(圖片來自BioTechniques)
EpiTect Methyl II PCR Array的操作流程如下圖。首先將起始的基因組DNA分成四等分，分別用于mock(Mo)、甲基化敏感(Ms)、甲基化依賴(Md)和雙酶切(Msd)消化。消化之后，酶反應液與qPCR預混液直接混合，上樣到帶有引物的PCR Array板中。在指定的循環條件下運行實時定量PCR。最后，將原始的Ct值復制粘貼到excel表中，它會自動計算甲基化和未甲基化DNA的相對量。
QIAGEN目前提供EpiTect Methyl II Signature PCR Array(22個基因)和EpiTect Methyl II Complete PCR Array(94個基因)，適用于人類、小鼠或大鼠研究，有96孔或384孔形式可選。目前有多種疾病和通路聚焦的PCR Array可供選擇，涉及癌癥、凋亡、細胞周期、DNA修復等，詳詢QIAGEN。
EpiTect Methyl II PCR System提供了：
? 對照限制性消化及qPCR檢測的聯合可靠性
? 全基因組、即用型、預設計的引物分析
? 單次qPCR運行中多個目標的同時分析
? 網頁式且自動化的免費數據分析工具
? 監控限制性內切酶酶活的對照
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所（嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室深圳分中心）和佛山鯤鵬現代農業研究院研究員唐中林團隊在國際期刊《腸道微生物》（GutMicrobes）上發表論文。該研究揭示......
記者10月6日從華中農業大學獲悉，該校棉花遺傳改良團隊開發出基于CRISPR/dCas13（Rx）的新型植物RNA甲基化編輯工具。研究成果日前發表于《先進科學》雜志。N6-甲基腺苷（m6A）是真核生物......
DNA甲基化是表觀遺傳修飾的重要組成部分，可以通過改變染色質的結構、DNA的穩定性以及DNA和蛋白質的結合程度調控基因表達。在植物DNA甲基化的建立和維持過程中，植物特有的RNA聚合酶V（PolV）通......
植物是復雜的生物系統。植物體內基因的表達受到多種水平的調控，如轉錄水平、轉錄后水平、DNA甲基化/去甲基化等，從而對基因表達進行精密高效的調控。中國科學院遺傳與發育生物學研究所張勁松研究組篩選OsEI......
時間如梭，衰老是自然界不可抗拒的規律，但衰老的步伐并非一成不變——即使在同齡人之間，生理功能的衰退和器官老化的程度也存在顯著差異。這些差異性說明個體的生物學年齡，即生理狀態所反映的年齡，可能與其實際年......
中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員石建濤，聯合上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院教授方海，在《基因組研究》（GenomeResearch）上，在線發表了題為ADNAmethylationhaplot......
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初級生產力中貢獻卓著，是頗有前景的合成生物學底盤細胞。為了探索工業固碳產油微藻的表觀遺傳機制和生理作用，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心以海洋微擬球藻......
9月14日，《自然-通訊》（NatureCommunications）在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心石建濤組完成的最新合作研究成果（DNAmethylationprofilingtode......
自閉癥（ASD）和精神分裂癥（SCZ）是常見的慢性精神疾病，在行為、遺傳學和神經病理學等方面存在相當多的重疊特征，提示自閉癥和精神分裂癥可能存在共同的神經發病機制。衰老與表觀遺傳效應的動態變化密切相關......
衰老，是一個復雜、多階段、漸進的過程，發生在生命的整個過程。隨著時間的流逝，人體的器官、肌肉會逐漸衰老，一些疾病也伴隨著年齡的增長而發生，包括癌癥、糖尿病、心血管疾病等。DNA甲基化，是一種DNA上的......