水中底泥和沉積物采集的辦法主要有兩種： 一種是直接挖掘的辦法，這種方法適用于大量樣品的采集，或者是一般需求樣品的采 集。在無法采到很深的河、海、湖底泥的情況下，亦可采用沿岸邊直接挖掘的方法。但是采集的樣品極易相互混淆，當挖掘機打開時,一些不粘的泥土組分容易流走，這時可以采用自制的工具采集。另一種是用類似巖心提取器的采集裝置，適用于采樣量較大而 不相互混淆的樣品，用這種裝置采集的樣品，同時也可以反映沉積 物不同深度層面的情況。使用金屬采樣裝置，需要內襯塑料內套以防止金屬沾污。當沉積物不是非常堅硬難以挖掘時，甲基丙烯酸甲 酯有機玻璃材料可用來制作提取裝置。這種裝置外形是圓筒狀的， 高約50cm，直徑約5cm，底部略微傾斜，以便在水底易于用手將 其插進泥土或使用錘子將其敲進泥土內。取樣時底部采用聚乙烯蓋子封住。對于深水采樣，需要能在船上操作的機動提取裝置，倒出來的沉積物，可以分層裝入聚乙烯瓶中貯存。在某些元素的形態分析中，樣品的分裝最好在充有惰性氣體的膠布套箱里完成，以避免 一些組分的氧化或引起形態分布的變化。