260/280的比值可以判斷比較嚴重的基因組污染。也可以通過跑瓊脂糖膠看加樣孔里亮不亮作為一個參考依據。其實一般很難保證RNA沒有基因組污染的，特別是加入氯仿后的劇烈震蕩會促進dna溶解到水相里，后面就很難分離了。有些許的基因組污染的樣品也能夠滿足大部分的實驗要求。所以在rt-pcr等試驗中才要求設計的引物要跨intron，這樣就可以區分擴增產物的模板來自于mRNA還是基因組dna
