尿常規檢查見白細胞計數增多或呈膿尿，伴有紅細胞增多，少數呈肉眼血尿，尿三杯試驗檢查，可以發現第1杯內有大量膿細胞，紅細胞存在，而第2杯，第3杯基本正常，初段尿細胞培養菌數明顯多于中段尿，尿道或陰道分泌物涂片檢查，淋菌性尿道炎可見細胞內或細胞外淋病雙球菌，非特異性尿道炎可用分泌物或前尿道拭子培養，見大量細菌生長，分泌物涂片及培養均未發現細菌者，即有支原體，衣原體感染的可能，可行特殊方法培養或做PCR檢查。
慢性尿道炎需行尿道膀胱鏡檢查，以明確發病的原因，有時可用金屬尿道探子試探尿道內有無狹窄，必要時行尿道造影，急性期尿道內忌用器械檢查。