1.一般治療
強調飲食調理和營養補充，給予高營養少渣飲食。適當給予葉酸，B12等多種維生素及微量元素。腹痛腹瀉必要時可給予抗膽堿藥或止瀉藥，合并感染者靜脈途徑給予廣譜抗生素。
2.藥物治療
（1）氨基水楊酸制劑：SASP對控制輕，中型患者活動性有一定療效，主要適用于病變局限在結腸者。
（2）糖皮質激素：控制病情活動最有效的藥物，適用于本病活動期。活動性強的可加用氨基水楊酸制劑或免疫抑制劑。
（3）免疫抑制劑：對糖皮質激素治療效果不佳的或糖皮質激素依賴的慢性活動期患者，加用此類藥物可減少糖皮質激素的用量甚至停用。
3.手術治療
手術適應證：并發完全性腸梗阻，瘺管與膿腫形成，急性穿孔或不能控制的大量出血。