少數腱鞘囊腫可自行消退，但也有部分患者經多種方法治療，仍反復發作。
1.非手術療法
雖然腱鞘囊腫保守治療復發率較高，但此類方法創傷最小，易于被患者接受，臨床上可作為首選方法。可通過擠壓使腱鞘囊腫破裂，逐漸自行吸收，但是治療后可能復發。與關節腔相通的不容易破裂，可采用穿刺方法抽出囊液，然后加壓按揉，或將囊液抽出后注入腎上腺皮質激素或透明質酸酶，局部加壓包扎2天，有一定療效。
2.手術治療
其他方法治療無效時，可手術切除腱鞘囊腫。術后應避免患病的關節劇烈活動，以防復發。
