疫苗是解決先天性巨細胞病毒感染最有希望的方法。有效的疫苗可防止發生神經系統后遺癥和其他殘疾,使兒童終身受益,并可強有力的節約社會醫療成本。目前正在臨床試驗階段,所以孕婦要盡可能降低暴露于先天性巨細胞病毒的風險。對于先天性巨細胞病毒感染的乳汁,建議在-20攝氏度冰箱中凍存24小時以上,可明顯降低先天性巨細胞病毒的傳染性,再用巴氏滅菌法,加熱62.5攝氏度約30秒,即可消除病毒感染性。