嬰兒肝病綜合征大多數病例預后良好，為減少嬰肝的發病，針對病因采取預防措施，首先應加強對母親圍生期的保健，防止感染，生后與產母生活上密切接觸如唾液、乳汁、大小便等，或周圍患者、帶菌者及病毒污染物接觸食入而感染也應受重視，母親為乙肝或陽性攜帶者的患兒如未經被動免疫預防，必須停母乳喂養。另外應避免孕期感冒，避免與貓密切接觸，忌食生肉以防弓形蟲感染。孕前或孕期作遺傳代謝病篩查。
