不論病因為何，所有肝腺泡均受累，出現斑片狀壞死及肝細胞嗜酸性壞死和單核細胞炎性浸潤。即使在疾病的早期，肝臟也可出現再生的組織學變化。除非肝細胞廣泛橋接壞死并貫穿整個腺泡，否則肝臟的基本網架往往不被破壞，而且組織學改變可完全恢復。在大多數病例，不管是哪一種病毒引起的肝臟病理學變化均很相似。乙肝病毒有時通過檢出"毛玻璃樣"肝細胞（因HBsAg累及胞漿）和對病毒成分的特殊免疫學染色可確診。然而，這些結果在急性乙型肝炎時很少出現陽性，而在慢性乙型肝炎時很典型，丙型肝炎有時可能根據一些微小的形態學變化而作出判斷。