血栓運行到肺部分對肺循環影響的大小，視血管阻塞的部位、面積、肺循環原有的儲備能力以及肺血管痙攣的程度而定。當肺動脈兩側的主要分支突然被屈打的血塊栓子阻塞以及血塊表面的血小板崩解釋放的體液因子如組胺、5－羥武色胺、多種前列腺素、血栓素A2等進入肺循環，可引起廣泛肺細小動脈痙攣，或因大量的小栓子同時發生肺小動脈栓塞造成肺循環橫斷面積阻塞過半時，均可使肺動脈壓急升，右心室排血受阻，發生右心室擴張與右心室衰竭。此外，可因左心血回流減少，左心排血量突然減少，血壓下降，冠狀動脈供血不足等影響左心功能。
