典型的急性腎盂腎炎起病急驟，臨床表現為發作性的寒戰，發熱，腰背痛（肋脊角處有明顯的叩擊痛），通常還伴有腹部絞痛，惡心，嘔吐，尿痛，尿頻和夜尿增多，本病可發生于各種年齡，但以育齡婦女最多見，主要有下列癥狀。
1.一般癥狀
高熱，寒戰，體溫多在38℃～39℃，也可高達40℃，熱型不一，一般呈弛張型，也可呈間歇或稽留型，伴頭痛，全身酸痛，熱退時可有大汗等。
2.泌尿系癥狀
患者有腰痛，多為鈍痛或酸痛，程度不一，少數有腹部絞痛，沿輸尿管向膀胱方向放射；體檢時在上輸尿管點（腹直肌外緣與臍平線交叉點）或肋腰點（腰大肌外緣與十二肋交叉點）有壓痛，腎區叩痛陽性，患者常有尿頻、尿急、尿痛等膀胱刺激癥狀，在上行性感染時，可先于全身癥狀出現。
3.胃腸道癥狀
可有食欲不振、惡心、嘔吐，個別患者可有中上腹或全腹疼痛。
4.菌血癥和膿毒血癥
有癥狀的急性腎盂腎炎患者，在其疾病過程中都可并發菌血癥。
5.休克和彌散性血管內凝血（DIC）
6.兒童患者
兒童患者的泌尿系癥狀常不明顯，起病時除高熱等全身癥狀外，常有驚厥，抽搐發作，2歲以下小兒可出現發熱，嘔吐，非特異性的腹部不適或不好動。