急性附件炎的臨床表現有時易與急性闌尾炎異位妊娠、卵巢囊腫蒂扭轉或卵巢子宮內膜異位囊腫相混淆，診斷時應注意鑒別。
急性闌尾炎右側急性附件炎易與急性闌尾炎混淆。病史中有輕微臍周疼痛伴有胃腸道癥狀如惡心、嘔吐或腹瀉疼痛逐漸加重，轉移到右下腹呈持續性鶒，體溫可升高。檢查時有腹肌緊張、麥氏點固定壓痛、反跳痛。右側急性附件炎壓痛常在麥氏點以下，婦科檢查宮頸舉痛或觸痛，對側附件也常有觸痛。
異位妊娠異位妊娠有停經史、陰道流血和內出血體征如面色蒼白、脈搏加快、血壓下降或休克檢查時有腹肌緊張、壓痛且反跳痛非常劇烈，尿人絨毛膜促性腺激素(HCG)常呈陽性，后穹隆穿刺為不凝固血。
卵巢囊腫蒂扭轉發生蒂扭轉的卵巢囊腫中，最常見的是卵巢畸胎瘤。可有下腹包塊史突然發生下腹劇烈疼常伴惡心、嘔吐、發熱甚至休克。卵巢囊腫蒂扭轉后發生感染時，需與輸卵管卵巢膿腫進行鑒別。檢查時有腹肌緊張、壓痛及反跳痛，婦科檢查一側附件區可捫及一張力較大、邊界清楚、觸痛明顯的囊腫。B超檢查可輔助診斷。
卵巢子宮內膜異位囊腫有痛經、不孕、性交疼痛的病史。腹痛多發生在月經期，一般不伴發熱。婦科檢查可捫及子宮后位、固定，子宮后壁有觸痛結節，宮骶韌帶增厚，有痛性結節，附件區可捫及腫塊，有輕壓痛可進行B超檢查，腹腔鏡檢查則可明確診斷。